OBJECTIVES: Avaliar o mercado de antimicrobianos no Brasil, em 2009, subsidiando a Agência Nacional de Vigilância Sanitária na implantação do monitoramento e controle do consumo desses medicamentos em farmácias e drogarias privadas. METHODS: Estudo descritivo que congrega as áreas do conhecimento em vigilância sanitária e economia do medicamento. A seleção dos antimicrobianos foi definida a partir da lista anexa da norma regulatória (RDC nº 44/2010, atualizada pela RDC nº 61/2010). Essa norma determinou o controle sanitário por meio da retenção de receita médica nos estabelecimentos farmacêuticos e escrituração eletrônica no Sistema Nacional de Gerenciamento de Produtos Controlados (SNGPC). No Brasil, existia uma cultura de dispensação dos antimicrobianos sob prescrição médica sem a apresentação de receita médica. Foi analisado o total e quantidade de apresentações farmacêuticas comercializadas, participação dos antimicrobianos no mercado total de medicamentos, os antimicrobianos mais vendidos no país e o custo habitante dia (CHD). RESULTS: Na norma foram definidos 119 antimicrobianos sob prescrição médica, resultando em mais de duas mil apresentações farmacêuticas vendidas no país, das quais 251 são de uso restrito aos hospitais. A quantidade comercializada ultrapassou mais de 270 milhões de unidades físicas. A participação do mercado de antimicrobianos, em termos de quantidades vendidas, foi de 9,1%. A amoxicilina (14,6%), azitromicina (8,8%) e cefalexina (7,6%) foram os antimicrobianos mais vendidos no país. O CHD foi de R$ 36,25, ou seja, para cada 1.000 habitantes foram gastos R$ 36,25 em antimicrobianos diariamente. CONCLUSIONS: A análise do mercado de antimicrobianos no país sinaliza para um grande volume de dados a serem escriturados no SNGPC, cuja principal finalidade é o monitoramento sanitário e farmacoepidemiológico do consumo desses medicamentos no Brasil. Essa estratégia visa ao fortalecimento da política de medicamentos e assistência farmacêutica no país, no que diz respeito ao uso seguro e racional de medicamentos no país.