OBJECTIVES: Comparar as relações de custo-utilidade dos antipsicóticos haloperidol, risperidona e olanzapina no tratamento de pacientes com esquizofrenia crônica atendidos ambulatorialmente em um Centro de Atenção Psicossocial (CAPS) pelo Sistema Único de Saúde (SUS) em Santa Catarina (SC) Brasil. METHODS: Foi realizado um levantamento em prontuários de pacientes atendidos no CAPS II Policlínica Central de Florianópolis SC para caracterizar o perfil dos pacientes usuários do CAPS e de seus tratamentos farmacológicos. Foi construído um modelo de análise de decisão de três meses e um modelo de Markov de cinco anos, para avaliar os custos diretos e os resultados associados aos antipsicóticos, utilizando-se o programa Treeage®. Os custos foram avaliados desde a perspectiva do SUS/SC. As utilidades, medidas em Anos de Vida Ajustados pela Qualidade (AVAQ), foram obtidas na literatura. RESULTS: Os resultados do modelo de árvore de decisão sugerem que entre os antipsicóticos avaliados, num período de três meses quando não ocorreram trocas na medicação, a risperidona apresenta a melhor relação de custo-utilidade sendo dominante ao haloperidol e demonstrando utilidade semelhante com um custo significativamente inferior quando comparada à olanzapina. No modelo de Markov onde ocorrem trocas de medicação em decorrência da descontinuação dos tratamentos, os resultados apontam para a utilização dos antipsicóticos risperidona e haloperidol antes da utilização da olanzapina como alternativas mais custo-efetivas em razão do elevado custo de tratamento atribuído à utilização da olanzapina. CONCLUSION: Os desfechos e os custos associados aos antipsicóticos, ainda são motivo de controvérsia no estabelecimento de protocolos de tratamento em diversos países. Desde a perspectiva do Sistema Único de Saúde brasileiro os antipsicóticos haloperidol e risperidona apresentaram melhor relação de custo-utilidade quando comparados à olanzapina. O estabelecimento e o cumprimento de estratégias que priorizem a utilização destes antipsicóticos podem otimizar recursos sem prejudicar a saúde dos pacientes atendidos.