OBJECTIVES:: Determinar la prevalencia de automedicación y sus factores asociados en usuarios de boticas y farmacias en Perú. METHODS:: Se realizó un análisis secundario de datos del cuestionario 4 de la Encuesta Nacional de Satisfacción de Usuarios de los Servicios de Salud (ENSUSALUD 2015). El muestreo fue probabilístico bietápico, se tomó como unidades primarias a las boticas y farmacias, y como unidades secundarias de muestreo a los usuarios que acudieron a estos establecimientos. Se definió automedicación como la compra de medicamentos sin receta médica. La información se recolectó inmediatamente después de la compra de medicamentos. Se empleó regresión de Poisson y se estimaron razones de prevalencia (RP) con sus intervalos de confianza (IC) al 95% para muestreo complejo. RESULTS:: Se analizaron 2 637 participantes; la edad media fue de 40,9 años (IC95%: 39,8-41,9) y la prevalencia de automedicación fue de 75,0% (71,1-78,5). Se asociaron con automedicación en el análisis ajustado: ser varón (RP: 1,05; IC95%: 1,02-1,09), no contar con seguro médico (RP: 1,06; IC95%: 1,02-1,10), la falta de pedido de receta durante la venta de medicamentos (RP: 2,89; IC95%: 2,37-3,51) y el gasto promedio en medicamentos que compró (RP: 0,92; IC95%: 0,89-0,95). El 68,0% de los participantes se automedicaron con fármacos que requerían receta médica para su venta, siendo principalmente: AINES (23,5%), antibióticos (22,6%) y fármacos gastrointestinales (15,3%). CONCLUSIONS:: Se hallaron factores sociodemográficos asociados a la práctica de automedicación. Se sugiere utilizar la información para implementar políticas sanitarias con la finalidad de reducir la práctica de forma irresponsable de la automedicación.