OBJECTIVES: Realizar un  análisis de costo-efectividad del uso del escáner cervical (como agente diagnóstico en pacientes mexicanas con riesgo asociado a cáncer de Cérvix por VPH, desde el punto de vista del sector público de salud en México. METHODS: La población objetivo del estudio fueron pacientes que tuvieron resultados positivos en prueba de PAP y necesitan una segunda prueba para identificar verdaderos positivos. Para demostrar la eficiencia del escáner cervical en esta población se realizó un análisis de costo-efectividad mediante el diseño de un árbol de decisiones para comparar el escáner cervical  vs colposcopía con un horizonte temporal de 5 años. Se considera como medida de eficacia los  verdaderos positivos identificados por cada intervención, los costos calculados corresponde a los verdaderos positivos no identificados a tiempo y el costo de ambas pruebas. Se ejecutó un análisis de sensibilidad univariado modificando: el costo, la efectividad, el horizonte temporal, pacientes atendidos al año, se realizó también un análisis de sensibilidad probabilístico. RESULTS: Los resultados para escáner cervical mostraron un costo de $81,905,308.55 pesos con 13,380 verdaderos positivos identificados, para colposcopía el costo fue de  $210,942,475.77 pesos con 8,134 verdaderos positivos identificados en el horizonte temporal de 5 años considerando que se pueden tratar 9,300 pacientes al año. Los análisis de sensibilidad demostraron que el escáner cervical siempre se mantuvo dominante al variar los  parámetros que podrían generan mayor incertidumbre. CONCLUSIONS: La opción de escáner cervical  es costo-efectiva para el sistema de salud pública en México siendo dominante frente a colposcopia, considerada el estándar de atención en mujeres que han dado positiva la prueba PAP, al identificar un mayor número de verdaderos positivos y de esa forma dar un tratamiento preventivo a pacientes con virus de VPH antes de desarrollar cáncer cervicouterino.