OBJECTIVES: Estimar el costo en salud del Programa Articulado de Salud Materno Neonatal para reducir la tasa de mortalidad materna y neonatal en el Perú, 2009-2014. METHODS: Se desarrolló bajo la metodología de uso de recursos médicos, en referencia al recurso humano, materiales médicos  y equipamiento. Se tomó en consideración la asignación presupuestal al Programa de Salud Materno Neonatal, en el marco de Presupuesto por Resultados (PpR). Se contrastó el uso de recursos médicos por el Programa de Salud Materno Neonatal versus la meta de los indicadores de resultados del programa (tasa de mortalidad materna y tasa de mortalidad neonatal) tomados de la Encuesta de Demografía y salud familiar (ENDES) 2007-2014. RESULTS: El uso de recursos médicos en el Programa de salud Materno Neonatal  se  incrementó en el periodo 2009-2014  en recursos humanos de $ 69 713,248  a $ 218 511,087, materiales e insumos médicos de $ 51 446,570 a $ 163 575,934, equipamiento de $7 530587 a $ 23 120,516. La tasa de mortalidad neonatal se redujo de 13 a 11. La tasa de mortalidad materna se redujo de 103 a 93. CONCLUSIONS: Se evidencia un importante incremento presupuestal en el Programa Articulado Salud Materno Neonatal lo que se traduce en una reducción  de la tasa de mortalidad materna del 10% en el periodo 2009 a 2014 y una reducción  del 15% de la tasa de mortalidad neonatal en el periodo 2009 a 2014. Sin embargo, se requiere una mejora en la calidad de gasto que permita alcanzar el quinto objetivo de desarrollo del milenio (mejora de la salud materna).