OBJECTIVES: Estimar la costo-efectividad de anidulafungina en el tratamiento de la candidiasis invasiva en Colombia. METHODS: Se construyó un árbol de decisión para determinar la razón de costo-efectividad incremental (ICER, por su sigla en inglés) de anidulafungina IV (200 mg en el primer día y 100 mg como dosis de mantenimiento) comparado con: anfotericina B deoxicolato IV (0,7-1,0 mg/kg al día); anfotericina B liposomal IV (5 mg/kg al día); caspofungina IV (70 mg en el primer día y 50 mg como dosis de mantenimiento) y fluconazol IV (100 mg al día) en el tratamiento de la candidiasis invasiva. La perspectiva fue la del sistema de salud. Se incluyeron solo costos médicos directos, expresados en dólares (1 USD$ = COP 1.971). El horizonte temporal fue la esperanza de vida. Se utilizó una tasa de descuento de 5%. Los resultados se midieron en años de vida ajustados por calidad (AVAC). Los datos de eficacia, seguridad y utilidad se tomaron de la literatura. Se realizaron comparaciones indirectas usando un método bayesiano. Los precios de los medicamentos se tomaron de la base de datos oficial (SISMED) y de la regulación de precios vigente. Se realizaron análisis de sensibilidad univariados y probabilísticos. RESULTS: Los costos totales esperados por paciente fueron: anidulafungina USD$ 4,685.61; anfotericina B deoxicolato USD$ 928.22; anfotericina B liposomal USD$ 25,569.12; caspofungina USD$ 3,368.48 y fluconazol USD$ 628.39. Los resultados para cada alternativa en términos de AVAC fueron: anidulafungina 3,08; anfotericina B deoxicolato 2,26; anfotericina B liposomal 1,90; caspofungina 2,14 y fluconazol 2,46. El ICER por AVAC de anidulafungina comparado con fluconazol fue USD$ 6,521.38. Anfotericina B deoxicolato, anfotericina B liposomal y caspofungina fueron alternativas dominadas. CONCLUSIONS: Asumiendo como umbral para Colombia el PIB per cápita (USD$ 7,609.42)  por AVAC, anidulafungina es una alternativa costo-efectiva para el tratamiento de la candidiasis invasiva.