OBJECTIVES: Determinar la relación de Costo-Efectividad del implante de Ahmed en comparación con el implante de Baerveldt en la reducción de la presión intraocular (PIO) y su seguridad de uso de acuerdo a la tasa de complicaciones quirúrgicas y postoperatorias en pacientes operados de glaucoma crónico. METHODS:  Se utilizó un modelo de árbol de decisión de costo-efectividad para establecer la comparación entre las alternativas: implante de Ahmed e implante de Baerveldt, las probabilidades del modelo se determinaron mediante una revisión sistemática de la literatura biomédica y meta-análisis, la efectividad es la reducción de la PIO, los costos de los procedimientos fueron calculados en pesos chilenos a valor actual desde el punto de vista de una institución de salud, mediante un método de microcosteo. Los datos fueron integrados en el modelo y analizados mediante el programa DATA TreeAge, con los cuales se calculó la razón de costo-efectividad de cada una de las alternativas de tratamiento. Se realizó un análisis de sensibilidad y una simulación de Montecarlo, además se calculó la razón de Costo-Efectividad Incremental (ICER) generada por una alternativa respecto de la otra. El horizonte de tiempo del análisis fue de 1 año, debido a esto no se utilizaron tasas de descuento.  RESULTS: El implante de Baerveldt es la alternativa dominante del análisis, el análisis de sensibilidad mostró que los resultados obtenidos son robustos.  CONCLUSIONS: El implante más costo-efectivo según la perspectiva del sistema de salud fue el de Baerveldt para tratar a pacientes adultos operados de glaucoma crónico.