OBJECTIVES: Estimar los costos de enfermedades mentales prevalentes (EMP) de los servicios a brindar en los establecimientos del Ministerio de Salud del Perú. METHODS: Se realizó una evaluación económica parcial de tipo costo de enfermedad (CE). La población de estudio fue una cohorte hipotética de pacientes afiliada al Seguro Público de Salud (Seguro Integral de Salud) en el Perú. Los costos se estimaron desde la perspectiva del financiador tomados para el año 2014. La definición de los esquemas de manejo clínico (procedimientos médicos y medicamentos para el diagnóstico, tratamiento y seguimiento de la enfermedad) provienen de las Condiciones Asegurables del Plan Esencial de Aseguramiento en Salud (PEAS). Cada esquema de manejo clínico se ha estimado con la metodología de costeo estándar. El costo total fue ajustado por factores de oferta, demanda y adherencia. RESULTS: La cohorte hipotética de pacientes con enfermedades mentales prevalentes (EMP) es de 75,584 (Incidencia  esquizofrenia: 1% en mayores de 19 años; incidencia de ansiedad: 19.5%; incidencia de depresión: 9% en adulto mayor y gestantes e incidencia de alcoholismo: 11.6% en mayores de 18 años). El costo total para EMP es de 21,922,517 dólares distribuido según enfermedad para esquizofrenia 3,351,980 dólares (15%), ansiedad 2,040,292 dólares (9%); depresión 12,621,897 dólares (58%) y para  alcoholismo 3,908,348 (18%). El costo total correspondiente a prevención es 943,888 dólares (4.3%), diagnóstico 1,776,595 dólares (8.1%), tratamiento 15,033,481 dólares (68.6%) y para seguimiento 4,168,552 dólares (19%). El costo fijo correspondió a 10,180,833 dólares (46.4%) y el costo variable a 11,741,683 dólares (53.6%). CONCLUSIONS: El costo anual total para enfermedades mentales prevalentes en el país se estimó en 21,922,517 dólares. Este monto representa el 91.4% del presupuesto asignado 2015 del Programa Presupuestal 131 Control de Enfermedades Mentales.