OBJECTIVES: Las diferentes vacunas conjugadas antineumocóccicas han demostrado reducir la carga de enfermedad asociada a Streptococcus pneumoniae. El objetivo de este trabajo es estimar la costo-efectividad de las vacunas conjugadas antineumocóccicas PCV13 y PCV10 en Colombia. METHODS: Se construyó un modelo de Markov, para simular los resultados en salud de un programa de vacunación en una cohorte hipotética de 676.835 niños. Se empleó el esquema de vacunación 2+1 para PCV13 y PCV10. Con base en los hallazgos de eficacia, efectividad y efecto rebaño de la revisión sistemática, se construyeron diferentes escenarios de costo-efectividad  para cada vacuna frente a no vacunar y vacunar con PCV13 comparada con PCV10 La perspectiva fue la del sistema de salud. El horizonte temporal fue la esperanza de vida (75 años). Se incluyeron costos médicos directos que se expresaron en dólares (USD). Se aplicó una tasa de descuento de 3% para costos y resultados en salud. Los resultados se expresaron en número de casos (otitis media aguda, neumonía y enfermedad invasiva), muertes evitadas y años de vida ganados (AVG). Se realizaron análisis de sensibilidad univariados y probabilísticos. RESULTS: La inversión del programa de vacunación en millones de dólares fue: PCV13 (USD 31.513.438) y PCV10 (USD 28.379.692). De acuerdo a los parámetros de eficacia, efectividad y efecto rebaño considerados, PCV13 evitaría en niños entre 848 y 564 muertes en el escenario más y menos optimista, respectivamente. Del mismo modo, PCV10 evitarían entre 498 y 403 muertes. CONCLUSIONS: PCV13 y PCV10 son estrategias costo-ahorradoras frente a no vacunar .PCV10 fue dominada frente a PCV-13 en los escenarios más optimistas de ambas vacunas. La razón de costo-efectividad incremental fue USD$ 1.863 /AVG para PCV-13 comparada con PCV10 en los escenarios menos optimistas de ambas vacunas.