OBJECTIVOS En México se estima que existen ≥100 mil casos nuevos detectados/año de trombosis venosa profunda (TVP) que originan >500,000 días/hospitalización y que la tromboembolia pulmonar (TEP) tiene una mortalidad intra-hospitalaria cercana al 47%. El objetivo de este trabajo fue identificar la alternativa más costo-efectiva para la profilaxis de la ETV desde la perspectiva del IMSS. METODOLOGÍAS Evaluación económica completa. Se construyó un árbol de decisiones comparando los resultados en salud (estimados mediante meta-análisis) de tres alternativas anticoagulantes actualmente disponibles en el IMSS (heparina más warfarina, enoxaparina y fondaparinux) y los costos de la atención en el contexto de esa institución, versus los resultados y costos alcanzados por el uso del innovador dabigatrán. RESULTADOS El esquema profiláctico basado en heparina no fraccionada más warfarina fue tomado como comparador común por ser el de menor precio y uno de los más empleados. Dabigatrán resultó ser la alternativa dominante en la profilaxis de TVP con una ICER de -$62.64 (IC95% $61.71 - $63.57) por caso evitado. Lo mismo sucedió en el caso de TEP donde la ICER fue de -$1,002.28 (IC 95% $987.39 - $1017.17) por caso evitado. Un análisis de sensibilidad multivariado confirmó estos resultados. CONCLUSIONES Debido a que dabigatrán es un medicamento oral, de dosis fija y de efecto predecible, facilita un mayor apego al esquema profiláctico en comparación con el esquema comparador y con ello disminuye el riesgo de TVP o de TEP. Dabigatrán es la opción más eficiente para prevenir estos eventos en el contexto del IMSS.